Родился 29 августа 1967 года в городе Москве.
В 1990 г. окончил Московский физико-технический институт, прикладная математика и физика.
Директор в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институт космических исследований Российской академии наук, член-корреспондент РАН.
Помимо руководства Институтом, Анатолий Петрукович активно занимается экспертной работой по планированию космических исследований и космической деятельности в целом.
Принимал участие в российских и международных космических проектах «Интербол», «Geotail», «Cluster». В настоящее время под его руководством разрабатываются и проводятся эксперименты на российских КА «Спектр-Р», «Резонанс», «Луна-Глоб». Он является представителем РФ в координационной группе космических агентств по солнечно-земной физике (ILWS).
ИКИ РАН — базовая организация для трех кафедр в составе факультетов МФТИ, НИУ ВШЭ и МГУ им. М. В. Ломоносова. Институт активно сотрудничает с МАИ, МГТУ им. Н. Э. Баумана, МИИГАиК и другими вузами. ИКИ участвует в проектах Правительства Москвы «Академический (научно-технический) класс» и «Космический класс», постоянно проводит экскурсии для школьников в выставочный зал и лаборатории. Подписаны соглашения о сотрудничестве с рядом школ и досуговых учреждений ЮЗАО.
В мае 2024 года победил в предварительном голосовании партии «Единая Россия» по Москве для выдвижения в Московскую городскую думу VIII созыва по избирательному округу №35.