Родился 26 ноября 1979 года в Москве.
В 2001 году окончил Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Государственный университет управления».
С 2000 по 2001 год — заместитель генерального директора московского ООО «Блок блэк», затем заместитель генерального директора по развитию сети ресторанов «Теремок».
C 2002 по 2011 год работал в группе компаний «Рускомпозит».
С 2002 по 2007 год возглавлял «Торговый дом «Стеклонит», входящий в группу «Рускомпозит».
С 2003 по 2004 год — генеральный директор «Комплексных систем изоляции».
В 2006 году защитил диссертацию на тему «Стратегия организационных изменений как инструмент эффективного управления и стал кандидатом экономических наук».
В 2007 году окончил Стокгольмскую школу экономики.
С 2007-го по 2009 год — генеральный директор в «Стеклонит менеджмент».
В 2008 году — доцент кафедры теории организации и управления Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Государственный университет управления».
С 2009-го по 2011 год — генеральный директор «Управляющей компании «Рускомпозит».
С 2011 по 2017 год — генеральный директор «Агентства стратегических инициатив по продвижению новых проектов».
В 2017 году указом Президента РФ назначен временно исполняющим обязанности губернатора Новгородской области, по результатам выборов избран главой региона.
В 2018 году защитил диссертацию на соискание учёной степени доктора экономических наук на тему «Формирование и обеспечение эффективного функционирования региональных управленческих команд».
11 сентября 2022 года победил на выборах главы Новгородской области.
Никитин является членом Президиума Совета при Президенте РФ по модернизации экономики и инновационному развитию России, членом Президиума Совета при Президенте РФ по стратегическому развитию и приоритетным проектам, членом Наблюдательного совета Агентства стратегических инициатив по продвижению новых проектов, членом комиссии РФ по делам ЮНЕСКО. Состоит в общественной организации «Деловая Россия»
Награжден медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени, Благодарностью Президента РФ.
Состоит в браке.